Как влияет Callbackhunter на позиции в Я.

Чейзер, колбаска, перезвоним - десятки их. Надо выбирать, исходя из того, что от сервиса нужно.

Вот вы говорите, что вас это раздражает, но вы забываете о том, что вы сеошники. А людям, которые в интернете не плавают как рыбы в воде - это может и нормально.

Меня тоже бесят эти попапы, но я понимаю, что вижу сайт немного не так, как обычный пользователь

Влияет только с точки зрения ПФ. А вот с ПФ могут быть разные варианты...

Поэксперименторовав на своих проектах решили убрать, т.к. "уникальный" алгоритм показа попапа у хантера абсолютной тупой - вылетает у всех подряд, в т.ч. при повторных заходах в течение суток. Настройками не лечится.

Как следствие, исходя из анализа данных вебвизора - 99% посетителей при вылете этого попапа уходит с сайта.